机械之心宣布
在 GenAI 发动的 “天生式科学智能（Generative Science）” 的新浪潮中，， ，，，，，生物基石模子始终是广受关注的热门领域；； ；；；；； ；自然界的生命语言（序列、结构）与人类符号语言泛起类似的序列化特征，， ，，，，，但其背后蕴含严苛的物理约束与生物演化逻辑，， ，，，，，恒久以来难为人类完全破解，， ，，，，，同时因其关于人类生产、生涯的要害主要作用，， ，，，，，使生物基石模子成为领域内广受关注的 “皇冠上的明珠”。。。。。。。。
生物基石模子的要害价值，， ，，，，，在于其能从海量信息中借助 Transformer 等 GenAI 架构充分翻开隐空间，， ，，，，，挖掘出人类难以感知归纳却又大有所用的 “生命语法”；； ；；；；； ；DeepMind 旗下的 AlphaFold 系列研究无疑是其中颇具开创性的重大突破。。。。。。。。
及至 AlphaFold 3 宣布后，， ，，，，，其征象级的突破性希望与重大工业潜力有目共睹，， ，，，，，成为毫无争议的行业规范。。。。。。。。随后，， ，，，，，围绕结构展望及与之亲近关联的重新设计应用，， ，，，，，全球相继涌现出一批以 GenAI 大模子追求突破的代表性效果（Chai Discovery、Boltz、OpenFold 等），， ，，，，，明星团队、大额融资及至大厂并购（Evolutionary Scale）等起劲新闻此起彼伏，， ，，，，，市场热度一连上涨；； ；；；；； ；但及至 2025 年底，， ，，，，，仍鲜有新发模子真正做到与 AlphaFold 3 匹敌［1］。。。。。。。。与此同时，， ，，，，，受限于开源水平、效能上限、安排便当性等，， ，，，，，生物基石模子的进一步普及应用仍面临高性能、高可用的需求端真实磨练。。。。。。。。
在生物基石模子的全球强烈竞逐中，， ，，，，，IntelliGen AI 于本周末正式宣布了 IntelliFold 2，， ，，，，，这是继 2025 年 7 月 IntelliFold 首版宣布后的一次重大升级 [2]。。。。。。。。
通过从 GenAI 内在逻辑出发的诸多创立性思索与重新设计，， ，，，，，以及诸多工程化� ？ ？ ？？？？ ？？榈耐黄菩粤⒁欤�， ，，，，，IntelliFold 2 乐成实现了高效能与多功效的周全突破，， ，，，，，在 FoldBench 基准测试中给出了逾越 AlphaFold 3 主要指标的优异体现；； ；；；；； ；在抗体 - 抗原相互作用、卵白 - 配体共折叠等影响药物研发成败的要害使命上，， ，，，，，IntelliFold 2 也树立了全新的行业性能标杆，， ，，，，，为智能药物设计提供了可控、高精度的工业级引擎。。。。。。。。
免费试用地点：https://server.intfold.com/
焦点突破：在要害性能指标上周全逾越 AlphaFold 3
在生命科学领域，， ，，，，，复合物共折叠（Co-folding）展望一直是焦点挑战。。。。。。。。IntelliFold 2 在两个要害使命中取得显著前进，， ，，，，，逾越 AlphaFold 3、Chai、Boltz 等主流模子：
抗体 - 抗原相互作用：以 DockQ > 0.23 为乐成标准，， ，，，，，IntelliFold 2-Pro 抵达 58.2% 的乐成率（报告的 v2 模子效果为 5 次运行的平均值，， ，，，，，最高分数达 63%），， ，，，，，相较 AlphaFold 3 的 47.9% 展现出显著的性能前进。。。。。。。。这一逾10 个百分点的提升，， ，，，，，意味着在抗体筛选阶段，， ，，，，，模子能够更稳健地迈过可用性门槛，， ，，，，，进而镌汰湿实验试错本钱，， ，，，，，精准锁定高潜力候补分子。。。。。。。。卵白质 - 配体共折叠：在该使命中，， ，，，，，IntelliFold 2-Pro 同样以67.7%的乐成率击败 AlphaFold 3（64.9%）及 Boltz 等其他主流模子 。。。。。。。。这一精度的稳步提升关于基于结构的小分子药物设计至关主要，， ，，，，，不但有助于提高虚拟筛选的掷中率，， ，，，，，也为后续亲和力展望、别构靶点捕获等详细使命打下了坚实基础。。。。。。。。
IntelliFold 2 的宣布，， ，，，，，通过v2-Flashv2v2-Pro三个版本，， ，，，，，精准笼罩了从学术微调到工业落地的多元需求。。。。。。。。现在已正式开源v2-Flashv2两个版本。。。。。。。。其中，， ，，，，，v2 版本作为现在精度最高的开源模子之一，， ，，，，，将为全球科研职员提供性能卓越的结构展望底座，， ，，，，，大幅降低高性能生物盘算的门槛 。。。。。。。。
“智能” 为径，， ，，，，，开启范式迭代：四大立异重塑新一代基座
IntelliFold 2 的焦点突破，， ，，，，，源于对 “信息表征能力” 和 “硬件盘算特征” 的重新思索。。。。。。。。针对共折叠（Co-folding）这一颇具挑战性的焦点使命，， ，，，，，团队并未因循古板的 “强数据堆砌” 或简单的 “专家履历注入” 路径，， ，，，，，而是追求生命分子微观交互纪律与 AI 盘算范式的深度融合，， ，，，，，以更好的实现 “底层模子智能” 对 “下游使命智能” 的赋能。。。。。。。。
Scaling Law 在生物盘算的验证：通过 Latent Space Scaling 手艺，， ，，，，，团队扩展了 PairFormer � ？ ？ ？？？？ ？？榈奶卣魑龋�， ，，，，，不但增强了模子对重大生物大分子相互作用的表征能力，， ，，，，，更大幅优化了盘算效率，， ，，，，，将 GPU 的盘算使用率（MFU）从 5% 提升至 30%。。。。。。。。这种算力投入带来了较高的边际效益，， ，，，，，以可接受的时间本钱，， ，，，，，换取了对重大结构表征能力的显著提升。。。。。。。。原子级别的细腻感知：针对抗体 CDR 区域等柔性、易变的结构，， ，，，，，古板粗粒度建模要领往往难以准确建模。。。。。。。。IntelliFold 2 引入了随机原子级 Tokenization，， ，，，，，让模子在训练中学会捕获细粒度的原子接触模式。。。。。。。。这种 “显微镜” 级别的感知力，， ，，，，，填补了宏观表征在局部细节上的缺失，， ，，，，，成为其在抗体展望使命中领先的要害。。。。。。。。强化学习指导的采样优化：为相识决扩散模子采样在结构展望使命中的不稳固性，， ，，，，，团队引入基于 PPO 算法的强化学习进一步优化扩散模子。。。。。。。。通过将扩散历程建模为随机战略并举行微调，， ，，，，，IntelliFold 2 有用校正了采样轨迹的偏移，， ，，，，，镌汰了禁绝确结构的天生，， ，，，，，为现实应用提供了可靠的工业级展望效果。。。。。。。。难度感知的损失函数：针对复合体中链间距离展望等高难度区域，， ，，，，，IntelliFold 2 接纳了难度感知的损失函数。。。。。。。。通过动态调解损失函数权重，， ，，，，，指导模子专注于那些容易被忽略的长尾难题区域。。。。。。。。这种优化改善了训练收敛稳固性，， ，，，，，提升了模子在处置惩罚重大多链复合物时的稳固性。。。。。。。。
IntelliFold 2 的手艺迭代体现了天生式科学的研发新范式，， ，，，，，它既不依赖古板专有数据注入或专家调优，， ，，，，，也非纯粹的对 Transformer block 堆叠提升参数目，， ，，，，，而是团结对领域科学和模子的综合深入明确，， ，，，，，找到好的 scaling 的角度，， ，，，，，遵照智能涌现的底层逻辑，， ，，，，，求解稳固可泛化的有用性能提升；； ；；；；； ；不然，， ，，，，，纯粹堆砌算力和参数目或者机械地对跨领域先验履历举行迁徙放大依然达不到好的效果。。。。。。。。
无邪可用：从可控展望到应用问题解决的领先实践
IntelliFold 2 不但仅实现了精度的提升，， ，，，，，还体现了关于可用性的强调：通过通用基础模子、轻量适配器（LoRA）与使命指导，， ，，，，，形成闭环推理链路，， ，，，，，毗连结构展望与诸多功效发明。。。。。。。。这逾越了古板单模子 - 单使命开发逻辑，， ，，，，，以统一基石模子 - 多使命的架构，， ，，，，，开创性拓展了却构模子的效能场景与价值链条。。。。。。。。同时，， ，，，，，这一架构设计也允许领域科学家注入假设、约束和数据，， ，，，，，为研究职员举行可控、精准且具有预见性的使命开发打下了立异支点。。。。。。。。藉由此次基石模子更新，， ，，，，，IntelliFold 2 在卵白 - 配体亲和力展望、别构靶点虚筛等应用问题上充分展示出显著更优且卓有价值的行业应用潜力。。。。。。。。
1. 亲和力展望（小分子）
IntelliFold 2 延续了初版的高保真亲和力展望能力，， ，，，，，不但在 PDBBind 数据集性能优于 Boltz-2 及模子初代版本，， ，，，，，还在更靠近工业真实使命的重大 In-house 数据集上亲和力展望体现（Pearson r = 0.60）显著领先 Boltz-2 等开源模子 (0.38)。。。。。。。。团结 IntelliFold 特有的别构和表位剖析能力，， ，，，，，已经形成 “展望结构→预计团结→指导设计” 的完整闭环，， ，，，，，并在真实案例中资助相助同伴在分子筛选使命上实现了效率与精度的大幅提升以及高难靶点的突破希望。。。。。。。。
2. 动态捕获靶点（别构效应）
在生命的微观天下里，， ，，，，，卵白质的功效并非由静态结构决议，， ，，，，，而是源于其在重大能量景观中的动态构象调控。。。。。。。。其中，， ，，，，，别构效应是最具代表性的机制之一：只需在卵白质的一端轻轻拨动 “开关”，， ，，，，，就能通过构象的连锁反应控制另一端的生化活性。。。。。。。。虽然这为药物研发提供了重大的想象空间，， ，，，，，但由于其高度的动态性和重大性，， ，，，，，寻找此类药物靶点犹如大海捞针。。。。。。。。
IntelliFold 2 构建了一套 “微观原子精度” 与 “宏观构象一致性” 协同的表征系统：在微观层面，， ，，，，，它能以原子级区分率捕获氨基酸侧链的细微偏移；； ；；；；； ；在宏观层面，， ，，，，，则能维持卵白质整体拓扑结构的物理合理性。。。。。。。。以此通用表征为基石，， ，，，，，通过针对性地引入别构数据举行高效微调，， ，，，，，模子进一步厦院剖析重大别构效应的能力。。。。。。。。
借助这一特殊机制的引入，， ，，，，，IntelliFold 2 实现了在真实使命上别构位点筛选能力，， ，，，，，并作为其动态靶点展望能力的首个应用案例；； ；；；；； ；后续乐成资助相助同伴实现了基于别构团结的候选分子重新筛选�。。。。。。。�， ，，，，，最终以特定靶点优异乐成率（高至 67%）实现多问题所有掷中，， ，，，，，并乐成转化至后续环节 asset 开发。。。。。。。。
结语 ——“Answer ball” from the East
在语言智能（Language Intelligence）和有形智能（Physical Intelligence）两大领域，， ，，，，，近年来的新一波 GenAI 浪潮一连带来强烈攻击与快速厘革迭代，， ，，，，，我们正亲历着一场将空前改变生产与生涯的智能大厘革。。。。。。。。围绕着大语言模子、具身智能、自动驾驶等赛道与工业的生长热潮，， ，，，，，我们欣喜地看到全球科技竞争的高速迭代和诸多优异效果的一直涌现，， ，，，，，中国科技实力一连追赶甚至并驾齐驱；； ；；；；； ；
然而在关联诸多领域科学和生产力前沿的 “天生式科学智能” 领域，， ，，，，，尤其是在相对高光的生命科学偏向，， ，，，，，差别于北美市场后 AlphaFold 3 时代模子探索的百花齐放，， ，，，，，现在在全球其他地区能够直接可比的基模效果并未几见。。。。。。。。受限于生物基石模子的高算力消耗门槛、LLM 与生物配景的复合人才需求，， ，，，，，大中华地区也更多是 Biomap、百度、字节跳动等互联网大厂配景团队在一连加入并取得阶段性效果。。。。。。。。
IntelliFold 2 的宣布，， ，，，，，及其模子 SOTA 体现与开源行动，， ，，，，，无疑是一记令人振奋的 “Answer ball”。。。。。。。。这批注围绕天生式科学的全球竞赛，， ，，，，，新兴团队仍然有时机加入竞争，， ，，，，，甚至取得领先的卓越体现。。。。。。。。
据悉，， ，，，，，得益于强盛的基石基础模子希望，， ，，，，，IntelliGen AI 首版针对 Binder 和抗体的重新设计（De novo design）模子也即将于 2026 年中适时宣布，， ，，，，，进而实现展望与天生的统一，， ，，，，，进一步加速药物研发与生命科学探索的历程。。。。。。。。
未来，， ，，，，，围绕生物基石模子的全球竞争无疑将越发强烈；； ；；；；； ；希望新一代际的立异者们能够实现 “科技有用”，， ，，，，，驱动 “智能药物设计时代” 的真正到来。。。。。。。。
［1］Xu, S., Feng, Q., Qiao, L. et al. Benchmarking all-atom biomolecular structure prediction with FoldBench. Nat Commun 17, 442 (2026). https://doi.org/10.1038/s41467-025-67127-3
［2］https://git沃林制药有限公司hub.com/IntelliGen-AI/IntelliFold